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近期，由于个人文章需要在小地理范围地形图上标注采样点，即一个精准位置标注的采样示意图。之前在中国地图上直接手动粗糙地标注采集点的方法已经难以满足当前较为严格的需求，经过一番查找琢磨，此处介绍一个基于ArcGis的采样示意图的制作方法，权当本人学习过程中的记录，以免遗忘。如能帮助他人，也算善事。

介绍使用BAPS推断群体遗传结构的具体方法。BAPS与STRUCTURE类似，都是基于哈温平衡假设和贝叶斯推断来估算个体的遗传聚类（K）归属。该软件支持多种数据类型，如SSR数据，二元数据以及连锁或者不连锁的gene序列等。相对于STRUCTURE，BAPS运行速度更快且对于居群间的样本量差异不敏感，可作为STRUCTURE遗传聚类分析的补充分析。

本文仅仅是为了记载我利用SSR数据进行群体遗传学分析的过程中所接触和使用的软件，以及少量相关的大名鼎鼎的软件，如果你刚开始群体遗传（仅在使用SSR数据时）学的研究，我想这些软件多数都可能对你有用，不妨一观。

在系统发育分析的过程中，由于对序列的命名和在文章中需要呈现的名字不一致，或者根据系统发育结果需要对序列重新命名时，就会遇到需要对发育树中分类群的名字进行更改的情况。如果需要更改的数量较多，就会相当麻烦。本文会提供一些技巧应对几种情况下的重命名需求。

本篇文章是为了记录本人在系统发育实验和数据分析过程中，所使用过的以及部分未使用但如雷贯耳的软件的集合。当然，相对于整个系统发育软件之汪洋大海，此处不过一滴水！

在Typora中轻松数学编辑公式。

本文是对如何向NCBI上传序列的详细介绍，不过本文完成时间较早，和最新的NCBI网页上传流程略有差别，不过应该影响不大！